The goal of my thesis is to apply computational tools to investigate the mutational load of rare variants in Joubert Syndrome. To this aim we: (a) implemented in a hospital setting a standard pipeline for the joint-genotyping of variants (b) developed dedicated annotation scripts to characterise the identified variants and measure the mutational load in patients; (c) carried out statistics analyses to understand the functional pathways affected by this mutational load.
L'obiettivo della mia tesi è di applicare strumenti computazionali per studiare il carico mutazionale di varianti rare nella sindrome di Joubert. A questo scopo ho: (a) implementato una pipeline ospedaliera standard per la genotipizzazione congiunta delle varianti (b) sviluppato script di annotazione dedicati per caratterizzare le varianti identificate e misurare il carico mutazionale nei pazienti; (c) effettuato analisi statistiche per comprendere le vie funzionali interessate da questo carico mutazionale.
Computational Genomics approaches to study rare-variants mutational load in Joubert Syndrome
BAGORDO, DAVIDE
2021/2022
Abstract
The goal of my thesis is to apply computational tools to investigate the mutational load of rare variants in Joubert Syndrome. To this aim we: (a) implemented in a hospital setting a standard pipeline for the joint-genotyping of variants (b) developed dedicated annotation scripts to characterise the identified variants and measure the mutational load in patients; (c) carried out statistics analyses to understand the functional pathways affected by this mutational load.È consentito all'utente scaricare e condividere i documenti disponibili a testo pieno in UNITESI UNIPV nel rispetto della licenza Creative Commons del tipo CC BY NC ND.
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https://hdl.handle.net/20.500.14239/14994