Analisi della via di segnalazione di ERK e p70S6K in un modello di cellule staminali pluripotenti indotte umane della sindrome da duplicazione 16p11.2

Optimized Workflow for Microbiome-Based Survival Analysis

Microbiome-based survival analysis is used to study the association between microbiome and clinically relevant time-to-event outcomes, such as disease onset, relapse, or treatment response. However, microbiome sequencing data are inherently compositional, high-dimensional, and sparse. This thesis develops and evaluates an optimized workflow for microbiome-based survival modeling, focusing on how alternative microbiome data structures and abundance transformations affect Cox proportional hazar...

ANALISI DEL REPERTOIRE DI NANOBODIES IN SEGUITO A IMMUNIZZAZIONE CON SARS-CoV-2

Bacillus subtilis per biotecnologie sostenibili

Bacillus subtilis, un importante microrganismo modello Gram-positivo, è spesso definito il “coltellino svizzero” della scienza e della biotecnologia grazie alla sua natura non patogena, all’adattabilità ecologica, alla versatilità metabolica e alla resilienza fisiologica. Inoltre, possiede la capacità di secernere enzimi degradativi di interesse industriale, di formare spore altamente resistenti agli stress ambientali e di sintetizzare biopolimeri di valore, come l’acido poli-γ-glutammico (γ-...

STUDIO DEL MECCANISMO ALLA BASE DI PKM2 E PKM1 NELLE CELLULE CORTICALI NERVOSE IN CONDIZIONE DI ISCHEMIA

L’ictus ischemico è una delle principali cause di mortalità e disabilità a livello globale e si caratterizza per una profonda alterazione del metabolismo energetico cerebrale. Neuroni e astrociti mostrano una vulnerabilità diversa all’ischemia, attribuibile alle loro distinte caratteristiche bioenergetiche e ai differenti profili di espressione delle isoforme della piruvato chinasi PKM1 e PKM2. PKM1, ad attività catalitica elevata, sostiene la fosforilazione ossidativa tipica dei neuroni, men...

Caratterizzazione del modello singenico di topo SB28 di glioblastoma, ed implicazione del pathway di AXL nella patologia.

Il glioblastoma multiforme (GBM) rappresenta il tumore cerebrale primitivo maligno più aggressivo e più frequente nell’adulto, caratterizzato da rapida crescita, estesa infiltrazione, marcata eterogeneità intra-tumorale e profonda resistenza alle terapie standard. Nonostante i progressi nelle strategie chirurgiche e chemio-radioterapiche, la prognosi rimane infausta, evidenziando la necessità di modelli preclinici in grado di riprodurre fedelmente la complessità molecolare, immunologica e mic...

Variazione della MIC del fluconazolo in Candida parapsilosis isolata da emocolture: mutazione o ceppi differenti?

I biomarcatori dello stato di attivazione infiammatoria ed endoteliale come predittori di rischio per l’insorgenza del cancro in soggetti sani: risultati dallo studio HYPERCAN.

Introduzione e scopo dello studio: La relazione tra infiammazione, coagulazione e progressione del tumore è nota da molti anni. Inoltre, ci sono prove sostanziali che indicano che l’infiammazione cronica associata al danno endoteliale possa aumentare la probabilità di sviluppare il cancro. L’obiettivo di questo studio esplorativo è determinare se la presenza di uno stato infiammatorio è in grado di predire la diagnosi di tumore in un gruppo di individui sani arruolati nello studio HYPERCAN (F...

Esplorazione dei nuovi strumenti per la valutazione delle interazioni proteina-proteina: AlphaFold e oltre.

La predizione delle interazioni proteina-proteina (PPIs) è sempre stata un obiettivo fondamentale della biologia strutturale. Questa tesi sviluppa e testa una pipeline computazionale per la predizione e la validazione di complessi proteici utilizzando strumenti di intelligenza artificiale. La pipeline integra AlphaPullDown (APD) e AlphaBridge (AB), confrontando le prestazioni rispetto ad AlphaFold3 (AF3), il metodo più avanzato attualmente disponibile. Un passo chiave è stato lo sviluppo di u...