True fruit flies (Tephritidae) and Drosophila suzukii (Drosophilidae) are among the most important insect pests, as their larvae feed on fresh fruit and cause losses to a wide variety of crops. These insects can locate their host plants using chemoreceptors, with females further using mechanoreceptors to locate, on the fruit peel, the optimal place to insert their ovipositor and lay eggs. Comparative studies between related species can help to clarify the genetic basis of biology and dietary preference. Here, we used available genomic data from six species of the genus Bactrocera, seven of the genus Drosophila including two with a similar egg-laying behavior (i.e. D. subpulchrella, D. suzukii), and one outgroup, to identify orthologs of six genes known to be involved in mechanoreception. Specifically, we focused on genes encoding for ion channels belonging to the TRP family (e.g. NompC, TrpA1) and on the gene Cirl (G-protein coupled receptor), which is involved in the perception of tactile stimuli. We then studied the patterns of evolution of these genes in a phylogenetic framework. Our results revealed clade specific duplications of the BRV gene in Drosophila and possible events of positive selection that may be associated with the specific egg-laying behavioral preference.
"EVOLUZIONE DEI GENI MECCANORECETTORI NEI MOSCERINI DELLA FRUTTA CON UN COMPORTAMENTO DI DEPOSIZIONE NELLA FRUTTA FRESCA" I moscerini della frutta (Tephritidae) e la Drosophila suzukii (Drosophilidae) sono tra i più importanti insetti parassiti, poiché le loro larve si nutrono di frutta fresca e causano perdite a un'ampia varietà di colture. Questi insetti sono in grado di localizzare le piante ospiti utilizzando chemorecettori, mentre le femmine utilizzano anche meccanorecettori per individuare, sulla buccia del frutto, il punto ottimale per inserire l'ovopositore e deporre le uova. Studi comparativi tra specie affini possono aiutare a chiarire le basi genetiche della biologia e delle preferenze alimentari. In questa sede abbiamo utilizzato i dati genomici disponibili di sei specie del genere Bactrocera, sette del genere Drosophila, tra cui due con un comportamento simile nella deposizione delle uova (D. subpulchrella e D. suzukii) e un outgroup, per identificare gli ortologhi di sei geni noti per essere coinvolti nella meccanorecezione. In particolare, ci siamo concentrati sui geni che codificano per canali ionici appartenenti alla famiglia TRP (ad esempio NompC, TrpA1) e sul gene Cirl (G-protein coupled receptor), coinvolto nella percezione degli stimoli tattili. Abbiamo quindi studiato i modelli di evoluzione di questi geni in un quadro filogenetico. I nostri risultati hanno rivelato duplicazioni specifiche del gene BRV in Drosophila e possibili eventi di selezione positiva che potrebbero essere associati alla specifica preferenza comportamentale per la deposizione delle uova.
“EVOLUTION OF MECHANORECEPTORS GENES IN FLIES WITH A FRESH FRUIT EGG-LAYING BEHAVIOUR”
MACCHIA, ALESSANDRO
2021/2022
Abstract
True fruit flies (Tephritidae) and Drosophila suzukii (Drosophilidae) are among the most important insect pests, as their larvae feed on fresh fruit and cause losses to a wide variety of crops. These insects can locate their host plants using chemoreceptors, with females further using mechanoreceptors to locate, on the fruit peel, the optimal place to insert their ovipositor and lay eggs. Comparative studies between related species can help to clarify the genetic basis of biology and dietary preference. Here, we used available genomic data from six species of the genus Bactrocera, seven of the genus Drosophila including two with a similar egg-laying behavior (i.e. D. subpulchrella, D. suzukii), and one outgroup, to identify orthologs of six genes known to be involved in mechanoreception. Specifically, we focused on genes encoding for ion channels belonging to the TRP family (e.g. NompC, TrpA1) and on the gene Cirl (G-protein coupled receptor), which is involved in the perception of tactile stimuli. We then studied the patterns of evolution of these genes in a phylogenetic framework. Our results revealed clade specific duplications of the BRV gene in Drosophila and possible events of positive selection that may be associated with the specific egg-laying behavioral preference.È consentito all'utente scaricare e condividere i documenti disponibili a testo pieno in UNITESI UNIPV nel rispetto della licenza Creative Commons del tipo CC BY NC ND.
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https://hdl.handle.net/20.500.14239/15122