Kinesins are motor proteins that convert ATP energy into movement, enabling the transport of cellular structures along microtubules. This process is critical for various cellular processes, including mitosis and intracellular trafficking, and especially for axonal transport in neurons. Kinesin-1s are among the major contributors to this transport. A malfunction can cause neurodegenerative diseases such as Parkinson's, Alzheimer's and hereditary spastic paraplegia. This thesis uses a computational strategy, based on MD simulations and virtual screening, to design potential "drug-like" modulators for the activation state of Kinesin-1, contributing to the search for cures for neurodegenerative diseases.

Le Kinesine sono proteine motrici che trasformano l’energia dell’ATP in movimento, permettendo il trasporto di strutture cellulari lungo i microtubuli. Questo processo è fondamentale per vari processi cellulari, tra cui la mitosi e il traffico intracellulare, e soprattutto per il trasporto assonale dei neuroni. Le Kinesine-1 sono tra le principali responsabili di questo trasporto. Un malfunzionamento può causare malattie neurodegenerative come il Parkinson, l’Alzheimer e la paraplegia spastica ereditaria. Questa tesi utilizza una strategia computazionale, basata su simulazioni MD e virtual screening, per progettare potenziali modulatori “drug-like” per lo stato di attivazione della Kinesina-1, contribuendo alla ricerca di cure per malattie neurodegenerative.

Design di modulatori del reclutamento del sistema cargo nella Kinesina I : un approccio basato su dinamica molecolare e in silico virtual screening.

LISITANO, ANDREA
2022/2023

Abstract

Kinesins are motor proteins that convert ATP energy into movement, enabling the transport of cellular structures along microtubules. This process is critical for various cellular processes, including mitosis and intracellular trafficking, and especially for axonal transport in neurons. Kinesin-1s are among the major contributors to this transport. A malfunction can cause neurodegenerative diseases such as Parkinson's, Alzheimer's and hereditary spastic paraplegia. This thesis uses a computational strategy, based on MD simulations and virtual screening, to design potential "drug-like" modulators for the activation state of Kinesin-1, contributing to the search for cures for neurodegenerative diseases.
2022
Design of modulators of cargo system recruitment in Kinesin I: an approach based on molecular dynamics and in silico virtual screening
Le Kinesine sono proteine motrici che trasformano l’energia dell’ATP in movimento, permettendo il trasporto di strutture cellulari lungo i microtubuli. Questo processo è fondamentale per vari processi cellulari, tra cui la mitosi e il traffico intracellulare, e soprattutto per il trasporto assonale dei neuroni. Le Kinesine-1 sono tra le principali responsabili di questo trasporto. Un malfunzionamento può causare malattie neurodegenerative come il Parkinson, l’Alzheimer e la paraplegia spastica ereditaria. Questa tesi utilizza una strategia computazionale, basata su simulazioni MD e virtual screening, per progettare potenziali modulatori “drug-like” per lo stato di attivazione della Kinesina-1, contribuendo alla ricerca di cure per malattie neurodegenerative.
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