STRUCTURE-BASED IN SILICO AND IN VITRO SCREENING OF ABC TRANSPORTERS TO CHARACTERIZE AND PREDICT DRUG–ABC TRANSPORTER INTERACTION.

studio dei trasportatori ABC in vitro e informatica per caratterizzare e predire le interazioni ligando-proteina Negli ultimi anni, l'Università di Helsinki si è concentrata sullo studio dei trasportatori attivi di tipo ABC per comprendere il loro comportamento e nuove molecole che potrebbero interagire con questi trasportatori attraverso la ricerca in vitro e in silico. La tesi che state leggendo tratterà del processo di anilisi computerizzata dei trasportatori sopra citati e delle molecole ad essi collegate, attraverso programmi che consentono la visualizzazione 3D di macro e micromolecole. Oltre al processo di analisi, verranno mostrati i metodi per la creazione in silico di quelli che sono stati chiamati "modelli". Il modello è un bersaglio biologico di natura proteica, attraverso il quale i siti di legame tra la proteina e il suo substrato possono essere virtualmente mostrati e trovati. Infine, verrà mostrato tutto il lavoro svolto in laboratorio per l'identificazione dei valori fondamentali su cui si basa il trasporto delle molecole da parte dei trasportatori ABC per determinare l'affinità che i ligandi di questi trasportatori mostrano nei loro confronti.