Rotavirus is a major cause of acute gastroenteritis in young children worldwide. Each year, Rotaviruses are associated with approximately 111 million episodes of acute gastroenteritis requiring home care, 25 million clinic visits and 2 million hospitalizations, representing a major economic burden for health care systems and families in both USA and European countries. Rotavirus infection is less frequent in adults, nevertheless chronic infection has been described in immunocompromised patients. In the present study we report the seasonal distribution and molecular characterization of Rotavirus in pediatric and adult hospitalized patients in the period September 2015-April 2018 in Pavia province, Lombardy Region. Stool samples of 1450 patients with gastroenteritis hospitalized at the Fondazione IRCCS Policlinico San Matteo of Pavia were analyzed to evaluate a potential Rotavirus infection. The stool samples were tested for the presence of Rotavirus with the routine immunochromatographic assay and 122 were Rotavirus positive, the majority belonging to pediatric patients (94.0%) while only a minority of patients (6.0%) were adults. The Rotavirus positive samples were retrospectively analyzed with Reverse Trascriptase Polymerse Chain Reaction and sequencing analysis for strain characterization. The highest number of Rotavirus cases were detected in the winter-spring period. The molecular characterization of Rotavirus strains confirmed that the “common” strains G3P[8], G1P[8], G9P[8] and G2P[4] were the most detected with an incidence rate of 82.4% in accordance with data of the Italian surveillance network RotaNet-Italia. Conversely, the incidence rate of “common” strains G3P[8], G1P[8], G9P[8] and G2P[4] obtained in our study were highly dissimilar to those found in Northern Italy in the period 2006-2009. This study highlights the variety of Rotavirus strains circulation in Northern Italy in hospitalized patients in a period of three years emphasizing distinct patterns of distribution in different age groups and between years.
I Rotavirus sono la principale causa di gastroenterite acuta nei bambini di tutto il mondo. Ogni anno, i Rotavirus sono associati approssimativamente a 111 milioni di episodi di gastroenterite acuta che richiedono assistenza domiciliare, 25 milioni di visite cliniche e 2 milioni di ricoveri, rappresentando così un grande dispendio economico per il sistema sanitario e per le famiglie sia negli USA che nei paesi Europei. Le infezioni da Rotavirus sono meno frequenti negli adulti, sebbene siano state descritte infezioni croniche in pazienti immunocompromessi. In questo studio è riportata la distribuzione stagionale e la caratterizzazione di Rotavirus in pazienti adulti e pediatrici, ricoverati nel periodo Settembre 2015-Aprile 2018 in provincia di Pavia, Regione Lombardia. Per valutare le potenziali infezioni da Rotavirus sono stati analizzati 1450 campioni di feci da pazienti con gastroenterite ospedalizzati presso la Fondazione IRCCS Policlinico San Matteo di Pavia. La presenza di Rotavirus nei campioni di feci è stata valutata mediante test immunocromatografico. Dei 122 campioni risultati positivi, la maggior parte appartenevano ai pazienti pediatrici (94%) mentre solo una minima parte a pazienti adulti (6%). I campioni positivi a Rotavirus sono stati retrospettivamente analizzati mediante Reazione a Catena della Polimerasi con Trascrittasi Inversa ed è stata effettuata l’analisi delle sequenze per la caratterizzazione dei ceppi. Il maggior numero di casi di Rotavirus è stato rilevato nel periodo inverno-primavera. La caratterizzazione molecolare dei ceppi di Rotavirus ha confermato una maggiore circolazione dei ceppi cosiddetti “comuni” (G3P[8], G1P[8], G9P[8] e G2P[4]), in conformità con i dati della rete Italiana di sorveglianza RotaNet-Italia, benchè la loro frequenza di circolazione sia discordante rispetto a quella riscontrata nel periodo 2006-2009 nel Nord Italia. Questo studio evidenzia la varietà della circolazione dei ceppi di Rotavirus nel Nord Italia in pazienti ospedalizzati in un periodo di tre anni e sottolinea la loro diversa distribuzione nelle differenti fasce di età e negli anni presi in esame.
Rilevazione e caratterizzazione molecolare di Rotavirus in pazienti ricoverati con gastroenterite acuta nel periodo Settembre 2015-Aprile 2018 in provincia di Pavia
LIPARI, GIUSEPPE
2017/2018
Abstract
Rotavirus is a major cause of acute gastroenteritis in young children worldwide. Each year, Rotaviruses are associated with approximately 111 million episodes of acute gastroenteritis requiring home care, 25 million clinic visits and 2 million hospitalizations, representing a major economic burden for health care systems and families in both USA and European countries. Rotavirus infection is less frequent in adults, nevertheless chronic infection has been described in immunocompromised patients. In the present study we report the seasonal distribution and molecular characterization of Rotavirus in pediatric and adult hospitalized patients in the period September 2015-April 2018 in Pavia province, Lombardy Region. Stool samples of 1450 patients with gastroenteritis hospitalized at the Fondazione IRCCS Policlinico San Matteo of Pavia were analyzed to evaluate a potential Rotavirus infection. The stool samples were tested for the presence of Rotavirus with the routine immunochromatographic assay and 122 were Rotavirus positive, the majority belonging to pediatric patients (94.0%) while only a minority of patients (6.0%) were adults. The Rotavirus positive samples were retrospectively analyzed with Reverse Trascriptase Polymerse Chain Reaction and sequencing analysis for strain characterization. The highest number of Rotavirus cases were detected in the winter-spring period. The molecular characterization of Rotavirus strains confirmed that the “common” strains G3P[8], G1P[8], G9P[8] and G2P[4] were the most detected with an incidence rate of 82.4% in accordance with data of the Italian surveillance network RotaNet-Italia. Conversely, the incidence rate of “common” strains G3P[8], G1P[8], G9P[8] and G2P[4] obtained in our study were highly dissimilar to those found in Northern Italy in the period 2006-2009. This study highlights the variety of Rotavirus strains circulation in Northern Italy in hospitalized patients in a period of three years emphasizing distinct patterns of distribution in different age groups and between years.È consentito all'utente scaricare e condividere i documenti disponibili a testo pieno in UNITESI UNIPV nel rispetto della licenza Creative Commons del tipo CC BY NC ND.
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https://hdl.handle.net/20.500.14239/23398