Quality control of phenotypic and genotypic data in Jordanian Awassi sheep, and missing data imputation through the use of bioinformatics software (PLINK 1.9, VCFtools, Beagle 4.1, Zanardi). Genotype-phenotype association study for binary data (cases vs controls) using the programming environment for statistical analysis with R, in particular the GenABEL package. Post-analytical interpretation of results and discussion of implications for possible future analysis.

Controllo di qualità dei dati fenotipici e genotipici di pecore giordane Awassi, e imputazione dei dati mancanti, tramite l’uso di software bioinformatici (PLINK 1.9, VCFtools, Beagle 4.1, Zanardi). Studio di associazione genotipo-fenotipo per dati binari (casi vs controlli) usando l’ambiente di programmazione per l’analisi statistica R, e in particolare il pacchetto GenABEL. Interpretazione post-analitica dei risultati e discussione delle implicazioni per possibili analisi future.

Studio di Associazione Genome-Wide (GWAS) su pecore giordane di razza Awassi affette da atresia anale

BARACCHI, PAOLO RICCARDO
2017/2018

Abstract

Quality control of phenotypic and genotypic data in Jordanian Awassi sheep, and missing data imputation through the use of bioinformatics software (PLINK 1.9, VCFtools, Beagle 4.1, Zanardi). Genotype-phenotype association study for binary data (cases vs controls) using the programming environment for statistical analysis with R, in particular the GenABEL package. Post-analytical interpretation of results and discussion of implications for possible future analysis.
2017
Genome-Wide Association Study (GWAS) in Jordanian Awassi sheep affected by atresia ani
Controllo di qualità dei dati fenotipici e genotipici di pecore giordane Awassi, e imputazione dei dati mancanti, tramite l’uso di software bioinformatici (PLINK 1.9, VCFtools, Beagle 4.1, Zanardi). Studio di associazione genotipo-fenotipo per dati binari (casi vs controlli) usando l’ambiente di programmazione per l’analisi statistica R, e in particolare il pacchetto GenABEL. Interpretazione post-analitica dei risultati e discussione delle implicazioni per possibili analisi future.
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Utilizza questo identificativo per citare o creare un link a questo documento: https://hdl.handle.net/20.500.14239/25277