Quality control of phenotypic and genotypic data in Jordanian Awassi sheep, and missing data imputation through the use of bioinformatics software (PLINK 1.9, VCFtools, Beagle 4.1, Zanardi). Genotype-phenotype association study for binary data (cases vs controls) using the programming environment for statistical analysis with R, in particular the GenABEL package. Post-analytical interpretation of results and discussion of implications for possible future analysis.
Controllo di qualità dei dati fenotipici e genotipici di pecore giordane Awassi, e imputazione dei dati mancanti, tramite l’uso di software bioinformatici (PLINK 1.9, VCFtools, Beagle 4.1, Zanardi). Studio di associazione genotipo-fenotipo per dati binari (casi vs controlli) usando l’ambiente di programmazione per l’analisi statistica R, e in particolare il pacchetto GenABEL. Interpretazione post-analitica dei risultati e discussione delle implicazioni per possibili analisi future.
Studio di Associazione Genome-Wide (GWAS) su pecore giordane di razza Awassi affette da atresia anale
BARACCHI, PAOLO RICCARDO
2017/2018
Abstract
Quality control of phenotypic and genotypic data in Jordanian Awassi sheep, and missing data imputation through the use of bioinformatics software (PLINK 1.9, VCFtools, Beagle 4.1, Zanardi). Genotype-phenotype association study for binary data (cases vs controls) using the programming environment for statistical analysis with R, in particular the GenABEL package. Post-analytical interpretation of results and discussion of implications for possible future analysis.È consentito all'utente scaricare e condividere i documenti disponibili a testo pieno in UNITESI UNIPV nel rispetto della licenza Creative Commons del tipo CC BY NC ND.
Per maggiori informazioni e per verifiche sull'eventuale disponibilità del file scrivere a: unitesi@unipv.it.
https://hdl.handle.net/20.500.14239/25277