Characterization of novel regulators involved in plant biomass degradation in Aspergillus niger. Caratterizzazione di nuovi regolatori coinvolti nella degradazione della biomassa vegetale in Aspergillus niger.

Asperigillus niger is a cosmopolitan filamentous ascomycete that developed a saprobic lifestyle, preferentially feeding on decaying plant material. To respond to its specific nutritional needs, it engages a broad set of Carbohydrate Active enzymes (CAZymes). The regulatory system involved in plant biomass degradation is complex and only partially understood. The main transcriptional factors of CAZyme-coding genes – xlnR, araR and amyR- are well characterized, nevertheless the fine-tuning part of the system and the role of secondary and back-up regulators are still unclear. A broader understanding of this issue is the aim of this study. Some putative novel regulators, previously identified by transcriptomic analysis, have been investigated by the production of A.niger N593 KU70 deletion knock-out mutants. Mutants with an interesting phenotype have been selected and biochemically characterized.

Asperigillus niger è un fungo filamentoso cosmopolita dallo stile di vita saprofito che si nutre preferibilmente di materiale vegetale in decomposizione. Per rispondere alle sue richieste nutrizionali, utilizza un largo set di enzimi attivi sui carboidrati (CAZymes). Il sistema di regolazione coinvolto nella degradazione della biomassa vegetale è complesso e solo parzialmente conosciuto. I principali fattori trascrizionali dei geni codificanti gli enzimi degradativi - xlnR, araR and amyR- sono ben caratterizzati , tuttavia i regolatori secondari e di "back-up" che partecipano alla regolazione fine del sistema sono ancora sconosciuti. Questo studio ha lo scopo di fornire una maggiore comprensione su questa problema. Alcuni nuovi regolatori putativi, precedentemente identificati grazie ad analisi transcrittomica, sono stati investigati mediate la produzione di mutanti knock-out per delezione di A.niger N593 KU70. I mutanti che mostravano un fenotipo interessante sono stati selezionati e sottoposti a caratterizzazione biochimica.