Comprensione della variazione intraspecifica nei tratti correlati alla dimensione degli occhi in Drosophilla melanogaster

La variazione naturale nella dimensione degli occhi composti è pervasiva negli insetti e riflette l'adattamento a diversi habitat e stili di vita. Per studiare la variazione delle dimensioni degli occhi, Drosophila melanogaster presenta un ottimo modello per rivelare i meccanismi molecolari e di sviluppo alla base dell'evoluzione dei tratti complessi. In questo studio, utilizziamo il pannello di riferimento genetico della Drosophila melanogaster (DGRP) per analizzare geneticamente la variazione intraspecifica nella dimensione degli occhi. È stata osservata un'enorme variazione nel numero di ommatidi tra 162 linee DGRP. Per stabilire un collegamento tra divergenza fenotipica e cambiamenti genetici, abbiamo eseguito studi di associazione su tutto il genoma (GWAS). Uno schermo di validazione funzionale dei tre geni contenenti la maggior parte dei polimorfismi a singolo nucleotide associati (muscleblind (mbl), slouch (sl), motivo tripartito contenente 9 (Trim9) e CG15498) ha confermato un potenziale coinvolgimento nella regolazione delle dimensioni degli occhi. Per comprendere meglio le interazioni specifiche e la variazione genetica regolata tra questi geni, sono stati progettati primer specifici per creare una libreria di cDNA che ci aiuta a quantificare l'espressione in base all'espressione variabile.

Natural variation in compound eye size is pervasive in insects reflecting adaptation to different habitats and lifestyles. To study eye size variation, Drosophila melanogaster presents a great model to reveal the developmental and molecular mechanisms underlying complex trait evolution. In this study, we employ the Drosophila melanogaster Genetic Reference Panel (DGRP) to genetically dissect the intraspecific variation in eye size. A tremendous variation in ommatidia number between 162 DGRP lines was observed. To establish a link between phenotypic divergence and genetic changes, we performed genome wide association studies (GWAS). A functional validation screen of the three genes containing most associated single nucleotide polymorphisms (muscleblind, (mbl;), slouch, (sl; ), Tripartite motif containing 9, (Trim9;) and CG15498) confirmed a potential involvement in eye size regulation performed in the Posnien lab. To better understand specific interactions and regulated genetic variation between these genes specific primers were designed to create a cDNA library which helps us to quantify expression based on variable expression.