Sviluppo di un protocollo, basato su mutazioni espresse, per lo studio della composizione clonale e della sua evoluzione nelle leucemie mieloidi acute pediatriche.

Paediatric acute myeloid leukaemia is characterised by high clonal heterogeneity, which may contribute to disease progression and relapse. In this thesis, a protocol based on expressed mutations was developed to analyse clonal composition and its evolution at the single-cell level. The approach integrated data from whole-exome sequencing, single-cell RNA sequencing and targeted Nanopore sequencing, enabling specific expressed mutations to be linked to the cellular transcriptomic profile. The results obtained demonstrate the feasibility of the method and support the utility of integrated strategies for studying clonal evolution in paediatric AML.

La leucemia mieloide acuta pediatrica è caratterizzata da elevata eterogeneità clonale, che può contribuire alla progressione e alla recidiva della malattia. In questa tesi è stato sviluppato un protocollo basato su mutazioni espresse per analizzare la composizione clonale e la sua evoluzione a livello di singola cellula. L’approccio ha integrato dati di whole-exome sequencing, single-cell RNA sequencing e sequenziamento mirato Nanopore, consentendo di associare specifiche mutazioni espresse al profilo trascrittomico cellulare. I risultati ottenuti dimostrano la fattibilità della metodica e supportano l’utilità di strategie integrate per lo studio dell’evoluzione clonale nella LAM pediatrica.