Fanconi anemia (FA) is a rare hereditary bone marrow failure syndrome caused by mutations in genes crucial for DNA interstrand cross-link (ICL) repair and replication fork stability. Although the activation of the FA/BRCA pathway is widely characterized at the protein level, its response coordination at the transcriptional level and the regulatory involvement of long non‑coding RNAs (lncRNAs) remain poorly defined. This study aimed to characterize the global transcriptional remodeling induced by genotoxic stress in HeLa cells, focusing on the temporal dynamics of FA/BRCA pathway genes and lncRNAs, and to investigate the upstream regulatory networks mediated by the E2F1 and E2F4 transcription factors.

L'Anemia di Fanconi (FA) è una rara sindrome da insufficienza midollare ereditaria causata da mutazioni in geni cruciali per la riparazione dei legami crociati interfilamento (ICL) e per la stabilità delle forcelle replicative. Sebbene l'attivazione della via FA/BRCA sia ampiamente caratterizzata a livello proteico, il coordinamento della sua risposta a livello trascrizionale e il coinvolgimento regolatorio dei lunghi RNA non codificanti (lncRNA) rimangono ancora poco definiti. Questo studio si è proposto di caratterizzare il rimodellamento trascrizionale globale indotto da stress genotossico in cellule HeLa, focalizzandosi sulle dinamiche temporali dei geni del pathway FA/BRCA e dei lncRNA, e di investigare i network di regolazione a monte mediati dai fattori di trascrizione E2F1 ed E2F4.

Alterazioni trascrizionali nella risposta al danno al DNA associata all’Anemia di Fanconi

TRIUNFO, ALICE
2025/2026

Abstract

Fanconi anemia (FA) is a rare hereditary bone marrow failure syndrome caused by mutations in genes crucial for DNA interstrand cross-link (ICL) repair and replication fork stability. Although the activation of the FA/BRCA pathway is widely characterized at the protein level, its response coordination at the transcriptional level and the regulatory involvement of long non‑coding RNAs (lncRNAs) remain poorly defined. This study aimed to characterize the global transcriptional remodeling induced by genotoxic stress in HeLa cells, focusing on the temporal dynamics of FA/BRCA pathway genes and lncRNAs, and to investigate the upstream regulatory networks mediated by the E2F1 and E2F4 transcription factors.
2025
Transcriptional alterations in the DNA damage response associated with Fanconi Anemia
L'Anemia di Fanconi (FA) è una rara sindrome da insufficienza midollare ereditaria causata da mutazioni in geni cruciali per la riparazione dei legami crociati interfilamento (ICL) e per la stabilità delle forcelle replicative. Sebbene l'attivazione della via FA/BRCA sia ampiamente caratterizzata a livello proteico, il coordinamento della sua risposta a livello trascrizionale e il coinvolgimento regolatorio dei lunghi RNA non codificanti (lncRNA) rimangono ancora poco definiti. Questo studio si è proposto di caratterizzare il rimodellamento trascrizionale globale indotto da stress genotossico in cellule HeLa, focalizzandosi sulle dinamiche temporali dei geni del pathway FA/BRCA e dei lncRNA, e di investigare i network di regolazione a monte mediati dai fattori di trascrizione E2F1 ed E2F4.
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