Querying large biomedical ontologies with SPARQL and OWL inferential reasoning

This research led to construction of stable architecture written in Java, which merges the potential of reasoners in an OWL-compatible environment, but which also supports the possibility of querying and uploading the inferred ontology in permanent triple stores. This software is able to apply the best performing OWL reasoners in a given ontology, both in a local and in an online service, and save the inferred axioms in a SPARQL endpoint, where it can be queried and manipulated further.

SPARQL e OWL reasoners per interrogazioni e deduzioni su ontologie biomediche di grandi dimensioni. La ricerca si basa sulla costruzione di un'architettura stabile scritta in Java, che fonde le potenzialità dei Reasoners in un ambiente compatibile con le specifiche OWL, che supporta anche la possibilità di interrogare e caricare l'ontologia inferita in triple store permanenti. Questo software è in grado di applicare i ragionatori OWL con le migliori prestazioni su una data ontologia, sia in locale che online, e salvare gli assiomi dedotti in un endpoint SPARQL, dove possono essere interrogati e manipolati ulteriormente.