One of the emerging challenges in biosensor research is the continuous monitoring of cardiac biomarkers, essential for early diagnosis and personalized management of heart failure. Among these, B-type Natriuretic Peptide (BNP) is a well-established diagnostic and prognostic marker. However, its application in point-of-care systems remains limited, due to its short plasma half-life and the constraints of conventional analytical methods. This thesis presents the design and preliminary evaluation of a miniaturized biosensor based on an Extended-Gate Field Effect Transistor (EGFET), specifically optimized for the selective and continuous detection of BNP. Two biological recognition elements (BREs) were assessed: an anti-BNP IgG antibody and its corresponding Fab fragment. Both were characterized using Bio-Layer Interferometry (BLI), which demonstrated high affinity for the target (KD < 1 nM). When integrated into the EGFET platform, the Fab-based sensor exhibited superior performance, with a more stable, reproducible, and selective electrical response. These results are attributed to the fragment’s smaller size, its oriented immobilization via Ni-NTA/His-tag chemistry, and improved compatibility with the electrical double layer (EDL). In parallel, the measurement protocol was refined and a detailed analysis of noise sources was performed, identifying optimal operating conditions to maximize the signal-to-noise ratio. Overall, this work sets the foundation for the future development of portable biosensors for real-time BNP monitoring in clinical settings.
Attualmente, una delle sfide emergenti nell’ambito dei biosensori è il monitoraggio continuo dei biomarcatori cardiaci per la diagnosi precoce e gestione personalizzata della malattia. In particolare, il peptide natriuretico di tipo B (BNP) è riconosciuto come marcatore diagnostico in caso di scompenso cardiaco. Tuttavia, è ancora poco utilizzato in formato point-of-care a causa del tempo di emivita breve e delle limitazioni delle metodiche convenzionali. Questo lavoro descrive la progettazione e la caratterizzazione preliminare di un biosensore miniaturizzato per la rilevazione selettiva e continua del BNP, utilizzando come trasduttore l’Extended-Gate Field Effect Transistor (EGFET). Sono stati valutati due elementi di riconoscimento biologico (BRE): l’IgG anti-BNP e il Fab anti-BNP. Entrambi sono stati caratterizzati mediante il Bio-layer Interferometry (BLI), e hanno dimostrato un'elevata affinità con l’analita target (KD < 1nM). L'integrazione nel sistema EGFET ha evidenziato una risposta elettrica più stabile, riproducibile e selettiva nel caso del frammento Fab. La risposta migliore è attribuibile alla minore dimensione, che favorisce l’inclusione nell’EDL, e all’orientamento controllato sull’elettrodo (Ni-NTA/His-tag). Inoltre, attraverso questo studio, si è ottimizzato il protocollo di misura e si è cercato di identificare i principali contributi di rumore del sistema mediante analisi mirate di condizioni operative, con l’obiettivo di migliorare il rapporto segnale/rumore. I risultati ottenuti pongono le basi per futuri sviluppi di sensori portatili per il monitoraggio continuo del BNP in ambito clinico.
Sensore elettrochimico miniaturizzato per il monitoraggio continuo del Peptide Natriuretico di Tipo B (BNP) basato su transistor a effetto di campo a gate esteso (EGFET)
GASTALDI, CARLOTTA
2024/2025
Abstract
One of the emerging challenges in biosensor research is the continuous monitoring of cardiac biomarkers, essential for early diagnosis and personalized management of heart failure. Among these, B-type Natriuretic Peptide (BNP) is a well-established diagnostic and prognostic marker. However, its application in point-of-care systems remains limited, due to its short plasma half-life and the constraints of conventional analytical methods. This thesis presents the design and preliminary evaluation of a miniaturized biosensor based on an Extended-Gate Field Effect Transistor (EGFET), specifically optimized for the selective and continuous detection of BNP. Two biological recognition elements (BREs) were assessed: an anti-BNP IgG antibody and its corresponding Fab fragment. Both were characterized using Bio-Layer Interferometry (BLI), which demonstrated high affinity for the target (KD < 1 nM). When integrated into the EGFET platform, the Fab-based sensor exhibited superior performance, with a more stable, reproducible, and selective electrical response. These results are attributed to the fragment’s smaller size, its oriented immobilization via Ni-NTA/His-tag chemistry, and improved compatibility with the electrical double layer (EDL). In parallel, the measurement protocol was refined and a detailed analysis of noise sources was performed, identifying optimal operating conditions to maximize the signal-to-noise ratio. Overall, this work sets the foundation for the future development of portable biosensors for real-time BNP monitoring in clinical settings.| File | Dimensione | Formato | |
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https://hdl.handle.net/20.500.14239/33508